Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX2P50458 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX2P50458 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX2P50458 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX2P50458 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX2P50458 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX2P50458 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX2P50458 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX2P50458 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX2P50458 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LHX2P50458 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LHX2P50458 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LHX2P50458 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms