Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC34P49427 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC34P49427 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC34P49427 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC34P49427 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC34P49427 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC34P49427 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC34P49427 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC34P49427 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms