Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTAP49354 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTAP49354 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTAP49354 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FNTAP49354 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNTAP49354 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTAP49354 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTAP49354 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms