Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITPNBP48739 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms