Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC1A2P43004 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms