Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NCAPD3P42695 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCAPD3P42695 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCAPD3P42695 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms