Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPHP41219 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPHP41219 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPHP41219 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPHP41219 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPHP41219 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPHP41219 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPHP41219 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms