Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL4P36578 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL4P36578 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL4P36578 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms