Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7BP35670 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP7BP35670 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms