Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCVRNP35243 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms