Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BMI1P35226 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BMI1P35226 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMI1P35226 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMI1P35226 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms