Protein–RNA interactions for Protein: P34161

YOX1, Homeobox protein YOX1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOX1P34161 YAL037WYAL037W 804 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YNL184CYNL184C 327 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 OST2YOR103C 393 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 ARR2YPR200C 393 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YPS6YIR039C 1614 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 BNA4YBL098W 1383 nt2.6□□□□□ -1.99
YOX1P34161 BFR1YOR198C 1413 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 MED1YPR070W 1701 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 MET5YJR137C 4329 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 SLK19YOR195W 2466 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 CAF120YNL278W 3183 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 snR65snR65 100 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 MRH1YDR033W 963 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 CPR5YDR304C 678 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YGR025WYGR025W 303 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 OTU2YHL013C 924 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 YLR434CYLR434C 384 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 KAR9YPL269W 1935 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 STE6YKL209C 3873 nt2.59□□□□□ -1.99
YOX1P34161 BUD4YJR092W 4344 nt2.59□□□□□ -2
YOX1P34161 SHS1YDL225W 1656 nt2.59□□□□□ -2
YOX1P34161 CWC22YGR278W 1734 nt2.59□□□□□ -2
YOX1P34161 JIP5YPR169W 1479 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 SYO1YDL063C 1863 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 BI4Q0120 1917 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 HUL5YGL141W 2733 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 SPG3YDR504C 384 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 GCN4YEL009C 846 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 YER097WYER097W 330 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 RMP1YLR145W 606 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 YAR029WYAR029W 225 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 YMR320WYMR320W 306 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 DPB3YBR278W 606 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 DBP7YKR024C 2229 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 DSF2YBR007C 2211 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 GEA1YJR031C 4227 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 SPE1YKL184W 1401 nt2.58□□□□□ -2
YOX1P34161 HFM1YGL251C 3564 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 SOK1YDR006C 2706 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 YDR340WYDR340W 303 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 YGR073CYGR073C 372 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 YIL141WYIL141W 390 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 JLP2YMR132C 627 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 INO4YOL108C 456 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 YOR121CYOR121C 306 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 PFY1YOR122C 381 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 SLH1YGR271W 5904 nt2.57□□□□□ -2
YOX1P34161 snR68snR68 136 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 SDH7YDR511W 402 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 MIC19YFR011C 513 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 VOA1YGR106C 798 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 TCD1YHR003C 1290 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 EMC2YJR088C 879 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 MRPL38YKL170W 417 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 snR35snR35 204 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 INP52YNL106C 3552 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 RIF1YBR275C 5751 nt2.56□□□□□ -2
YOX1P34161 PRP8YHR165C 7242 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 CBP2YHL038C 1893 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 DFG10YIL049W 762 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 YJL086CYJL086C 369 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 RGR1YLR071C 3249 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 ATX1YNL259C 222 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 YBR209WYBR209W 318 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 NMD2YHR077C 3270 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 DBP10YDL031W 2988 nt2.55□□□□□ -2
YOX1P34161 DBF20YPR111W 1695 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 IRC2YDR112W 309 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 CGR1YGL029W 363 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 YGR053CYGR053C 852 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 RPL11BYGR085C 525 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 ZEO1YOL109W 342 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 RPL11AYPR102C 525 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 SCY1YGL083W 2415 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 YKL222CYKL222C 2118 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 YDL199CYDL199C 2064 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 HOP1YIL072W 1818 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 MDM36YPR083W 1740 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 VIP1YLR410W 3441 nt2.54□□□□□ -2
YOX1P34161 YCK2YNL154C 1641 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 YJL132WYJL132W 2253 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 YFL032WYFL032W 321 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 YLR076CYLR076C 423 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 ICY1YMR195W 384 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 ICR1ICR1 3199 nt2.53□□□□□ -2
YOX1P34161 MNT3YIL014W 1893 nt2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.6 ms