Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXC9P31274 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC9P31274 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms