Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRIP30626 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRIP30626 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRIP30626 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms