Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB2P29033 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB2P29033 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB2P29033 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms