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Protein–RNA interactions for Protein: P29029
CTS1, Endochitinase, yeast
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562 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CTS1
P29029
YKU70
YMR284W
1809 nt
3.48
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
UBP12
YJL197W
3765 nt
3.48
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
VAC14
YLR386W
2643 nt
3.48
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
EPO1
YMR124W
2832 nt
3.48
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
ULP1
YPL020C
1866 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
CDC45
YLR103C
1953 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
RPO21
YDL140C
5202 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
YLR342W-A
YLR342W-A
174 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
YBL028C
YBL028C
321 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
YNL179C
YNL179C
438 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
HUB1
YNR032C-A
222 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
YKL100C
YKL100C
1764 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
SCW11
YGL028C
1629 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
SSM4
YIL030C
3960 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
YSW1
YBR148W
1830 nt
3.47
□□□□□ -1.85
CTS1
P29029
ASI1
YMR119W
1875 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
ERG28
YER044C
447 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YJL135W
YJL135W
318 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YJL150W
YJL150W
303 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YAL059C-A
YAL059C-A
423 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
HEM4
YOR278W
828 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
PEX6
YNL329C
3093 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
VPS52
YDR484W
1926 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YLL032C
YLL032C
2478 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RKM1
YPL208W
1752 nt
3.46
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SNX41
YDR425W
1878 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YCR081C-A
YCR081C-A
237 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YER088C-A
YER088C-A
324 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RPS0A
YGR214W
759 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RPC10
YHR143W-A
213 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RPL40A
YIL148W
387 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
COX19
YLL018C-A
297 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
TAR1
YLR154W-C
375 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
LSM2
YBL026W
288 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YOL085W-A
YOL085W-A
213 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YBR064W
YBR064W
429 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
LCB4
YOR171C
1875 nt
3.45
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
AIM21
YIR003W
2040 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SEC6
YIL068C
2418 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SPT6
YGR116W
4356 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
PCF11
YDR228C
1881 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
ROK1
YGL171W
1695 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SPI1
YER150W
447 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YMR194C-A
YMR194C-A
225 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
EGD1
YPL037C
474 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
MTR4
YJL050W
3222 nt
3.44
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SIN4
YNL236W
2925 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YGL074C
YGL074C
327 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YPR136C
YPR136C
513 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RAD26
YJR035W
3258 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
IRC3
YDR332W
2070 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
PRP39
YML046W
1890 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YRM1
YOR172W
2361 nt
3.43
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
BEM4
YPL161C
1902 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
FRE4
YNR060W
2160 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RAD54
YGL163C
2697 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
HTL1
YCR020W-B
237 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YER091C-A
YER091C-A
222 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
CDC26
YFR036W
375 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YGR174W-A
YGR174W-A
87 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
URM1
YIL008W
300 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
GPI14
YJR013W
1212 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RPL26A
YLR344W
384 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
PFY1
YOR122C
381 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
NTC20
YBR188C
423 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SMI1
YGR229C
1518 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
SPT10
YJL127C
1923 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YLR001C
YLR001C
2589 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
NPR2
YEL062W
1848 nt
3.42
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
HEF3
YNL014W
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3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
MNR2
YKL064W
2910 nt
3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
PUB1
YNL016W
1362 nt
3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
KIN82
YCR091W
2163 nt
3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
OSW7
YFR039C
1533 nt
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
MVP1
YMR004W
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3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
RAD61
YDR014W
1944 nt
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
TIF4631
YGR162W
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YEL075C
YEL075C
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3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
BAT1
YHR208W
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
TMA19
YKL056C
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CTS1
P29029
TVP18
YMR071C
504 nt
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
YOR050C
YOR050C
348 nt
3.41
□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
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YKL222C
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
REB1
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CTS1
P29029
CHD1
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CTS1
P29029
MSD1
YPL104W
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□□□□□ -1.86
CTS1
P29029
snR55
snR55
98 nt
3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
RPS29B
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□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
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□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
YDR464C-A
YDR464C-A
189 nt
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□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
SPT4
YGR063C
309 nt
3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
YKL111C
YKL111C
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3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
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YKL142W
660 nt
3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
EMP70
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3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
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YML086C
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3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
YOR008C-A
YOR008C-A
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3.4
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
YBR137W
YBR137W
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□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
DAN4
YJR151C
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3.39
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
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YBL051C
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3.39
□□□□□ -1.87
CTS1
P29029
ATG26
YLR189C
3597 nt
3.39
□□□□□ -1.87
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