Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD38P28907 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD38P28907 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD38P28907 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD38P28907 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD38P28907 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD38P28907 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms