Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX2P28328 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX2P28328 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX2P28328 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX2P28328 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX2P28328 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX2P28328 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms