Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTR2AP28223 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms