Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB9P28065 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms