Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB7P26010 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms