Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NFKBIAP25963 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFKBIAP25963 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms