Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2AP24928 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms