Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GADD45AP24522 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GADD45AP24522 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms