Protein–RNA interactions for Protein: P22004

BMP6, Bone morphogenetic protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP6P22004 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP6P22004 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP6P22004 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP6P22004 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP6P22004 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP6P22004 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP6P22004 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BMP6P22004 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP6P22004 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP6P22004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP6P22004 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP6P22004 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms