Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB4P21439 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB4P21439 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms