Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4BPBP20851 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BPBP20851 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms