Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms