Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFE3P19532 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFE3P19532 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFE3P19532 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms