Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCLP19338 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCLP19338 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCLP19338 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCLP19338 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCLP19338 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms