Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms