Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEFHP12036 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEFHP12036 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEFHP12036 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEFHP12036 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEFHP12036 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEFHP12036 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEFHP12036 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NEFHP12036 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEFHP12036 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEFHP12036 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEFHP12036 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEFHP12036 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms