Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALM1P0DP23 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALM1P0DP23 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms