Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms