Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC172P0C7W6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms