Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOP08100 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOP08100 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOP08100 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOP08100 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOP08100 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOP08100 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOP08100 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms