Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4AP04350 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms