Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTNP04004 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTNP04004 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTNP04004 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTNP04004 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms