Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DQB1P01920 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-DQB1P01920 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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