Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNTO95613 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNTO95613 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNTO95613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNTO95613 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNTO95613 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNTO95613 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNTO95613 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNTO95613 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms