Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX6O95475 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms