Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG5O95196 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms