Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAF4O95104 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAF4O95104 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAF4O95104 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAF4O95104 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCAF4O95104 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAF4O95104 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms