Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms