Protein–RNA interactions for Protein: O75410

TACC1, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC1O75410 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TACC1O75410 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TACC1O75410 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TACC1O75410 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TACC1O75410 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TACC1O75410 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TACC1O75410 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TACC1O75410 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TACC1O75410 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms