Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC22O60826 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms