Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA5O60264 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA5O60264 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms