Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3O43889 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3O43889 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3O43889 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREB3O43889 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3O43889 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3O43889 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms