Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRTM2O43300 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRTM2O43300 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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