Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARPC1BO15143 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms